De Hudson River begint aan Lake Tear of the Clouds en stroomt naar het zuiden door het oostelijke deel van de staat zonder de meren George of Champlain af te tappen. Lake George loopt aan zijn noordkant uit in Lake Champlain, waarvan het noordelijke uiteinde zich uitstrekt tot Canada, waar het uitmondt in de Richelieu en vervolgens in de Saint Lawrence Rivers. Vier van de vijf stadsdelen van New York liggen op drie eilanden aan de monding van de Hudson River: Manhattan Island; Staten Island; en Long Island, dat Brooklyn en Queens aan het westelijke uiteinde bevat.
Upstate en downstate worden vaak informeel gebruikt om New York City of zijn groter grootstedelijk gebied te onderscheiden van de rest van de staat New York. Het plaatsen van een grens tussen de twee is een kwestie van grote twist. Niet-officiële en losjes gedefinieerde regio’s van Upstate New York zijn onder meer de Southern Tier, die vaak de provincies langs de grens met Pennsylvania omvat, en de North Country, wat van de strook langs de Canadese grens tot alles ten noorden van de Mohawk-rivier kan betekenen.